Обработка микроскопических изображений. Лекция 7

Темы: 1. Использование трёхмерных данных 2. Проекция, реконструкция 3. Реконструкция объектов методом автоматической сегментации 4. Дополнительные возможности сегментации (глобальная и локальная, автоматическая, с использованием обучения нейронной сети, с использованием границ сегментации) 5. Реконструкция объектов вручную, с использованием плагина TrackEM2 (для серийных электронно-микроскопических срезов) Дополнительно: 1. Код для исправления ошибки TrackEM2 https://pastebin.com/7yJaJ9WE
2. Ссылка на планы по исправлению ошибки https://github.com/trakem2/TrakEM2/is...
3. Дополнительные материалы по TrackEM2: https://www.ini.uzh.ch/~acardona/trak...
https://imagej.net/TrakEM2_tutorials
4. Ссылка на плагин для реконструкции дендритов и аксонов    • Example of 3D Tracing in Simple Neurite Tr...